В настройках во вкладке Настройки интеграции указать нужную конфигурацию.
Во вкладке Свои остатки - Остатки по запросу к базе поставить галочку Использовать типовую загрузку остатков и заполнить параметры в таблице. (На скриншоте заполнение параметров на примере конфигурации Альфа-Авто6. Параметры на других конфигурациях могут отличаться.)
Во вкладке Свои остатки - Остатки из таблицы поставить галочку Использовать типовую загрузку остатков из таблицы и проставить необходимые настройки.
После выбора файла необходимо сопоставить колонки или указать значение по умолчанию. Обязательные к заполнению параметры отмечены галочкой.
Чтобы сохранить настройку колонок, можно сохранить шаблон под любым удобным названием и при обновлении выбрать нужный.